Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms