Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PparaP23204 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PparaP23204 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PparaP23204 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PparaP23204 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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