Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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