Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga5P11688 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga5P11688 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga5P11688 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga5P11688 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga5P11688 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga5P11688 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itga5P11688 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms