Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4P10628 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms