Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms