Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Spta1P08032 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms