Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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