Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GzmbP04187 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms