Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms