Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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