Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20878L7N244 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms