Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17535J3KMR8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms