Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21719J3KMI9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms