Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm12171-201ENSMUST00000150895 1257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-1G3UXB3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms