Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8005F6YKY3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8005F6YKY3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8005F6YKY3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8005F6YKY3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8005F6YKY3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8005F6YKY3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8005F6YKY3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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