Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8247F6VRJ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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