Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms