Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col22a1E9Q7P1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col22a1E9Q7P1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms