Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms