Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms