Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprbB2RU80 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprbB2RU80 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms