Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skint4A7TZF3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms