Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms