Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms