Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms