Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CcniQ9Z2V9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms