Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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