Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip6Q9Z1Y4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip6Q9Z1Y4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms