Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms