Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn13Q9Z0S4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Cldn13Q9Z0S4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn13Q9Z0S4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn13Q9Z0S4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn13Q9Z0S4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn13Q9Z0S4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn13Q9Z0S4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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