Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnt3Q9QZ47 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms