Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh11Q9QYF1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh11Q9QYF1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms