Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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