Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Csnk1dQ9DC28 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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