Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmem239Q9DA47 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms