Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rep15Q9D7T1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rep15Q9D7T1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rep15Q9D7T1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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