Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms