Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Srp19Q9D7A6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms