Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Nop56Q9D6Z1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nop56Q9D6Z1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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