Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms