Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc3Q9D114 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms