Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl11Q9CXW4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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