Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nip7Q9CXK8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nip7Q9CXK8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nip7Q9CXK8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nip7Q9CXK8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nip7Q9CXK8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nip7Q9CXK8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nip7Q9CXK8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nip7Q9CXK8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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