Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Utp23Q9CX11 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms