Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snw1Q9CSN1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snw1Q9CSN1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms