Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pard3bQ9CSB4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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