Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms