Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ykt6Q9CQW1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms