Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rpa3Q9CQ71 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpa3Q9CQ71 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpa3Q9CQ71 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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